根据目前所公开出来的情报，NDS版的《口袋妖怪 钻石&珍珠》将能与GBA的《口袋妖怪 红宝石&蓝宝石》、《口袋妖怪 火红&叶绿》以及《口袋妖怪 祖母绿》联动。玩家将可将GBA上培养的口袋妖怪带到NDS上。目前官方仍在研究具体情况。