MERYL SILVERBURGH二次见面

　　击倒Fox之后，就要和Meryl会合，她现在正身在B1并且扮成敌人的士兵，在电梯前大房间内左手边的就是她了，其实细心看就会发现她的步姿是和其他的士兵有所不同的，你可以选择在女厕所的柱子边等她（BT啊….b）。当她进女厕所后，你跟进去即可。会合Meryl之后，就要进入电梯和男厕所之间的走廊，那儿是通向所长室的。进入所长室之前，Meryl却无端因为头痛而出现了一些异常的举动，之后就可以进入所长室，而在室内留连了一会之后，Meryl却突然以自己的手枪指向你，还问你爱不爱她，究竟发生了什么事？

PSYCHO MANTIS恶搞开始

　　其实这时候Meryl是给Mantis操制了心智，Mantis就是那个出现在Meryl后面的黑影。而就在这时，Meryl也会开始攻击你，要制止她就一定要将她弄晕，方法有三。一是以拳脚功夫击晕她，二是以闪光弹“Stun Grenader”将她弄晕，三是用你手中的M9向她头射击。之后就要开始和Mantis交手了，相信大家都知道要把手柄从1P换到2P上，但NGC版的PSYCHO MANTIS要强很多，一定时间过后他就会检测到你的手柄，所以当他检测到后要换到3P上去，以至4P（这里也说明了NGC手柄热拔插是没有什么问题的，不要担心）。到Mantis的HP被扣得差不多的时候，他又会再控制Meryl向你攻击，之后更会要Meryl自杀，和之前一样，再次击晕Meryl就可以了。这时候Mantis就会改变他的攻击方式，以隐身来攻击你，有了之前的经验，这一次当然又是以Thermal Goggle来监视并攻击他啦！真正击倒Mantis后，他就会告知你通往大楼的通道，Snake和Meryl便再次出发。

狙击之狼SNIPER WOLF

　　经过书柜来到了一条通道之中，内里会有小量物资可补给，再往前走就会来到一个山洞，而在山洞之内是有着三只狼的，最好用M9让它们睡会再走过去，不然^^b，而在山洞之内有数个地方是要爬过去的，大家要多用主视点看清楚。如果被狼咬了Meryl就会嘲笑你。来到雷区，你除了可以跟着他走之外，还可以用Thermal Goggle去看清地雷的位置或者爬着过去（这招最好不要在女生面前用）。这时候Meryl会突然受到Sniper Wolf的攻击而不支到地，要救她就要返回之前的武器库那儿（这段情节之前是不能拿到AWP的），在一Level 5的门内会找到一把PGS-1的Sniper Rifle，不过拿之前要先切换为Thermal Goggle看清楚那些红外线。拿到Rifle之后就当然是回去和Sniper Wolf一决高下，并且救回Meryl。可是回到那儿除了看到地下的一滩血之外，那里看到Meryl的踪影呢？而这时大家也要和Sinper Wolf开战了，使用Rifle便会看见敌人是在远处的上层向你攻击的，这时就要以牙还牙了。不过Snake的手震那里利害，怎可能瞄准呢？快快吃下之前拾到的Diazepam镇定一下吧（这里要活用NGC手柄的操作技法，快速切换，也很简单）。

阶下囚

　　打到Sniper Wolf之后就可以向前进，并且在尽头转右，就在这时，应该已被打败了的Sniper Wolf却突然带了一班部下出现，Snake只好在众人包围之下束手就擒……当Snake再次醒来之后，又发觉自己竟然被“五花大绑”在一个拷问器上，这时之前被忍者斩下了左手的Ocelot就会以高压电流去向Snake严刑迫供，这时画面上会有两条Counter，绿色的一条就当然是表示Snake的HP啦，而另一条就是表示电击的时间，在被电击的时候，你需要不断地连打A键去回复Snake的HP。当然，你也可以选择投降（按A和start键），但是你的选择却会影响到你爆机时的结局和之后得到的隐藏物品，如果你选投降的话，到了结局的时候，Meryl便会被杀掉，与Otacon一起脱出得到隐形衣；反之，就可以救出Meryl，得到无限子弹。