胜利大逃亡

　　在两次的电流招供之后，Ocelot就会放弃，之后便会将你囚禁在一个牢房之内。过了一会儿，那名守卫就会因为闹肚子痛而离开了，这时Otakon就会来，交给你Level 6的通行证和其他两件道具，他离开后你就可以开始展开你的逃亡行动，要离开囚室有两个方法，第一个是伏在地上使用Ketchup扮流血装死、第二个方法是在守卫回来前躲在床下底，之后守卫就会进来看个究竟，这时将他击倒就可以走出囚室。离开后，到达另一个房间，就会发现一个木箱，内里除了可以拿回Snake的所有装备之外，还可以得到附加的“赠品”，Timer Bomb（时间3：00）一个，一定要立即扔掉。之后大家就会发现自己其实是在一开始囚禁离奇死亡的Darpa局长那儿。

通信大厦

　　回到之前被擒的地方之后，便进面前的大厦（这里不同与PS版，NGC版在这里换disc2），刚进门Snake就不小心被红外线发现了他的行踪，这时就会有大量敌人涌现，所以现时唯一可以做的事就是不断地往楼上逃跑（这个地方不断的扔Stun Grenader就可以了，还有记得要拿取地面上的Rope）…终于来到了顶楼，一出到天台，却突然受到飞弹的攻击，原来是另一个Snake（Liquid Snake）驾着直升机向你作出攻击，这时就要装备刚才提及的Rope（也可以不装备），再走到天台的边缘，按Y键Snake就会跳下去，大家要自己控制Snake走下去的路线，小心不要被Liquid打中的同时，安全到达地面。到了地上之后，就要走过天桥到另一层大厦，但是之前就最好先解决掉对面的三名守卫，而且最好就是使用一些长距离的道具，例如是PSG-1和NIKITA导弹。

蛇VS黄蜂

　　解决了三人之后就当然是向前跑啦，但是到了转角的位置便要小心了，因为Liquid其实是一直在那儿驾着直升机的准备攻击你，所以要尽快走回大厦之内。进入大厦之后，由于四下无人，首先当然是搜索（一定要拿到Stinger Luncher呀）！而在这一层内又有三条路可以走的，分别是走下去，走上楼和电梯，但是电梯又坏了，住上走的路又阻挡住了（连箱子都移不开，snake..汗），所以便唯有住下走啦，但是又发现住下的楼梯又断了，怎么辨呢？又走回头吧！当回到升降机那儿，就会见到Otakon博士，他说会帮你修好电梯（果然是博士，什么都会修理），这时你会发现那些箱子已经给移开了，继续往上走，但是就要小心那些（数量为1，2，3，4，5）的Gun Camera。上到天台后，Liquid已经在这儿等着你了，而你手上有着Stinger Luncher，又怎会放过这个报仇的好机会呢？大家只要小心避开它的攻击后，就可以用Stinger Luncher作出反攻，只要大家能把握到准星重叠的时候立即开火，不一会就可以将它击落的了（又是一个鸡肋boss）。